2003年是亚足联力推的亚冠赛首次正式上演，当时进入决赛阶段的只有16支队伍，而小组赛中也只有3场比赛，与目前有些不同。当年以联赛冠军身份参赛的大连实德在小组赛中顺利出线，最终仅仅是在半决赛中遗憾地被艾因以7-6总比分淘汰。尽管当年参赛的上海申花在小组赛中即被淘汰，但毕竟大连实德还是维护了中国球队的荣誉。
2004年亚冠赛的两支参赛队伍依旧是大连实德和上海申花。当时中国球队的代表大连实德还是顺利杀进八强，尽管四分之一决赛不太走运，被伊蒂哈德总比分2-1淘汰，但还是有了进入淘汰赛阶段的经历。
而那一年的上海申花开始阶段倒是和本赛季参加亚冠赛有些相似，前三场连续负于泰国BEC萨萨纳、全北现代和磐田喜悦，仅在理论上存在微弱出线可能。但尽管在后半程三场比赛中先后胜磐田喜悦、泰国BEC萨萨纳和全北现代，最终还是未能出线，最终为中国球队争得出线荣誉的队伍还是大连实德。
2005年亚冠赛对于中国球队来说是值得自豪的一年，当年山东鲁能与横滨水手一组依旧是6战全胜出线，虽然四分之一决赛输伊蒂哈德，但还是创造了本队在亚冠赛上的最好成绩，也比今年的参赛经历要好得多。另一支队伍深圳健力宝尽管内乱不断，但依旧是在与磐田喜悦和城南一和的死亡之组奇迹般地出线，最终甚至杀进四强！这也是从2004年改制起，有29支球队参加亚冠赛后中国球队的最好成绩。
2006年亚冠参赛的两支队伍又是大连实德和上海申花，这一次大连实德在前面的比赛中表现一直非常出色，在最后一轮之前还是形势相当好，最后一战只要平后来的亚冠冠军全北现代就可以出线，但最终还是未能打破魔咒，最终遗憾地输给对手，这也是大连实德参加亚冠以来唯一一次未能小组出线。
但此前一直萎靡不振的上海申花却抽得与三支东南亚球队一组的上上签，这种情况下，又有两支队伍由于报名时间问题被亚足联处罚而取消注册资格，上海申花只须胜隆安就可出现，几乎是捡来的八强，两回合全胜小组出线，这也是他们唯一一回小组出线，也维护了中国球队在亚冠赛以来至少有一支球队小组出线的荣誉。
但这一纪录未能在今年继续延续下去，此前上海申花就是4轮仅积1分后被提前两轮淘汰，小组赛的战绩也刷新了此前中国球队参加亚冠的最耻辱纪录！而山东鲁能在形势一片大好的时候也未能在小组出线，前4轮全胜最终成为迷惑自己的假象，最后一轮对城南一和的比赛终于在心理上完全崩溃，在输一球都出线的时候竟然以三球惨败，从而和上海申花一同创造了中国球队在亚冠赛首次均未能出线的最耻辱纪录！
