上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院,1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院(以下简称“九院”),2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并,九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。
九院是一所以口腔、整复外科和骨科为特色的内、外、妇、儿各科齐全的三级甲等综合性教学医院。近年来,以“精修医术、诚炼医德、广纳贤才、齐铸九院”的医院精神,以“科教兴院、人才强院”的发展战略,在医、教、研、管理等方面取得了可喜成绩。已连续十届评为上海市文明单位,并获“全国城市医院文化建设先进集体”荣誉称号。
医院占地面积61亩。医院核定床位1000张,口腔综合椅位260张,临床科室33个,医技科室9个。全院职工2200余人,医疗专业技术人员占82%以上,其中副高职称以上专家350余人。现拥有3位中国工程院院士:著名整复外科专家张涤生、口腔颌面外科专家邱蔚六、骨科专家戴尅戎,以及国家973项目首席科学家曹谊林教授和上海市十大科技精英、上海市领军人才、卫生部突出贡献中青年专家张志愿教授。
医院拥有3 个上海市临床医学中心(口腔临床、整复外科、关节外科)和2个上海市临床医疗质量控制中心(口腔医学、医学美容)。口腔临床医学、整复外科与组织工程学、外科学(骨科)现为国家重点学科,口腔基础医学现为国家重点培育学科。2009年教育部学位与研究生学位发展中心公布的2007~2009学科评估高校排名结果,上海交通大学口腔医学以80分与北京大学并列排名全国第二。口腔医学、整复外科学、骨科学为教育部第三期“211工程”重点建设学科。口腔黏膜病科列为国家中医药管理局重点专科。组织工程学为上海市“重中之重“学科,口腔颌面外科为上海市重点学科(优势学科),口腔修复生物材料学为上海市重点学科(特色学科),口腔基础医学和眼科学为上海市第三期重点学科,骨科为上海市教委重点学科。眼科、麻醉科、泌尿外科、内分泌科为上海交通大学医学院重点学科。也是上海交通大学医学院血管病诊治中心、疝与腹壁外科疾病诊治中心单位。